MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mahella australiensis 50-1 BON chromosome

Total Repeats: 64417

< Previous12345678910111213...128129Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_015520	CAC	2	6	96418	96423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332980707
2003	NC_015520	ATTGG	2	10	96446	96455	20 %	40 %	40 %	0 %	332980707
2004	NC_015520	TTG	2	6	96496	96501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332980707
2005	NC_015520	TAT	2	6	96520	96525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332980707
2006	NC_015520	CT	3	6	96531	96536	0 %	50 %	0 %	50 %	332980707
2007	NC_015520	AAAAGA	2	12	96601	96612	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332980707
2008	NC_015520	GTG	2	6	96617	96622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332980707
2009	NC_015520	GATG	2	8	96625	96632	25 %	25 %	50 %	0 %	332980707
2010	NC_015520	GTTATT	2	12	96663	96674	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332980707
2011	NC_015520	AGG	2	6	96707	96712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332980707
2012	NC_015520	TCG	2	6	96761	96766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332980708
2013	NC_015520	GCAAGC	2	12	96791	96802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332980708
2014	NC_015520	A	6	6	96829	96834	100 %	0 %	0 %	0 %	332980708
2015	NC_015520	ACT	2	6	96926	96931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332980708
2016	NC_015520	AGC	2	6	96960	96965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332980708
2017	NC_015520	CAT	2	6	97023	97028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332980708
2018	NC_015520	ATA	2	6	97162	97167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332980708
2019	NC_015520	ACC	2	6	97194	97199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332980708
2020	NC_015520	TA	3	6	97278	97283	50 %	50 %	0 %	0 %	332980708
2021	NC_015520	GA	3	6	97317	97322	50 %	0 %	50 %	0 %	332980708
2022	NC_015520	AGCA	2	8	97385	97392	50 %	0 %	25 %	25 %	332980708
2023	NC_015520	TACT	2	8	97412	97419	25 %	50 %	0 %	25 %	332980708
2024	NC_015520	AGC	2	6	97502	97507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332980708
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2029	NC_015520	AAG	2	6	97796	97801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332980708
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2031	NC_015520	GCA	2	6	97882	97887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2033	NC_015520	TAT	2	6	98015	98020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_015520	T	6	6	98029	98034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_015520	TTTAA	2	10	98049	98058	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2037	NC_015520	TAAT	2	8	98118	98125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_015520	GGCGA	2	10	98141	98150	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2039	NC_015520	TATT	2	8	98203	98210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_015520	TAT	2	6	98223	98228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_015520	A	6	6	98233	98238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_015520	T	6	6	98239	98244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_015520	AGG	2	6	98247	98252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_015520	TTTA	2	8	98296	98303	25 %	75 %	0 %	0 %	332980709
2045	NC_015520	ATA	2	6	98319	98324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332980709
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2050	NC_015520	AT	3	6	98661	98666	50 %	50 %	0 %	0 %	332980709
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2110	NC_015520	TGA	2	6	101710	101715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332980711
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2113	NC_015520	AT	3	6	101816	101821	50 %	50 %	0 %	0 %	332980711
2114	NC_015520	TA	3	6	101857	101862	50 %	50 %	0 %	0 %	332980711
2115	NC_015520	TGC	2	6	101928	101933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332980711
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2119	NC_015520	TGA	2	6	102022	102027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332980711
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2122	NC_015520	GCCG	2	8	102193	102200	0 %	0 %	50 %	50 %	332980711
2123	NC_015520	TGC	2	6	102250	102255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332980711
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2125	NC_015520	GCTTT	2	10	102333	102342	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2126	NC_015520	TAT	2	6	102357	102362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332980712
2127	NC_015520	AGT	2	6	102386	102391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332980712
2128	NC_015520	CCTTG	2	10	102401	102410	0 %	40 %	20 %	40 %	332980712
2129	NC_015520	AT	3	6	102443	102448	50 %	50 %	0 %	0 %	332980712
2130	NC_015520	GTT	2	6	102549	102554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332980712
2131	NC_015520	GCG	2	6	102640	102645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332980712
2132	NC_015520	AT	3	6	102757	102762	50 %	50 %	0 %	0 %	332980712
2133	NC_015520	CTA	3	9	102767	102775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332980712
2134	NC_015520	ATG	2	6	102961	102966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332980712
2135	NC_015520	TCA	2	6	102988	102993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332980712
2136	NC_015520	T	6	6	103179	103184	0 %	100 %	0 %	0 %	332980712
2137	NC_015520	TAT	2	6	103230	103235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332980712
2138	NC_015520	T	7	7	103330	103336	0 %	100 %	0 %	0 %	332980712
2139	NC_015520	CGT	2	6	103337	103342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332980712
2140	NC_015520	AT	3	6	103360	103365	50 %	50 %	0 %	0 %	332980712
2141	NC_015520	GAT	2	6	103394	103399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332980712
2142	NC_015520	TGTA	2	8	103418	103425	25 %	50 %	25 %	0 %	332980712
2143	NC_015520	GTA	2	6	103527	103532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332980712
2144	NC_015520	TTG	2	6	103539	103544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332980712
2145	NC_015520	TCC	2	6	103555	103560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2146	NC_015520	TGT	2	6	103592	103597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2147	NC_015520	CGA	2	6	103600	103605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2148	NC_015520	T	6	6	103612	103617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2149	NC_015520	AT	3	6	103655	103660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2150	NC_015520	ATTA	2	8	103671	103678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2151	NC_015520	A	6	6	103686	103691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2152	NC_015520	ATGA	2	8	103737	103744	50 %	25 %	25 %	0 %	332980713
2153	NC_015520	ATG	2	6	103749	103754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332980713
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2157	NC_015520	CGAT	2	8	103915	103922	25 %	25 %	25 %	25 %	332980713
2158	NC_015520	TTG	2	6	103974	103979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332980713
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2162	NC_015520	ATA	2	6	104104	104109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332980713
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2165	NC_015520	TGA	2	6	104494	104499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332980713
2166	NC_015520	TCTT	2	8	104544	104551	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2167	NC_015520	CAT	2	6	104560	104565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2211	NC_015520	AAG	2	6	106977	106982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2212	NC_015520	AT	3	6	107122	107127	50 %	50 %	0 %	0 %	332980715
2213	NC_015520	TGCCA	2	10	107187	107196	20 %	20 %	20 %	40 %	332980715
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2238	NC_015520	ATCG	2	8	108834	108841	25 %	25 %	25 %	25 %	332980716
2239	NC_015520	GTA	2	6	108908	108913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332980716
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2241	NC_015520	CTC	2	6	108943	108948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332980716
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2244	NC_015520	ATC	2	6	109258	109263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332980717
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2247	NC_015520	AGC	2	6	109400	109405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332980717
2248	NC_015520	CTTTGA	2	12	109419	109430	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332980717
2249	NC_015520	CAA	2	6	109444	109449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332980717
2250	NC_015520	TAT	2	6	109450	109455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332980717
2251	NC_015520	GAT	2	6	109459	109464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332980717
2252	NC_015520	TAT	2	6	109504	109509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332980717
2253	NC_015520	AAG	2	6	109535	109540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332980717
2254	NC_015520	ACGA	2	8	109576	109583	50 %	0 %	25 %	25 %	332980717
2255	NC_015520	GAC	2	6	109615	109620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332980717
2256	NC_015520	TGG	2	6	109656	109661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332980717
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2273	NC_015520	TGT	2	6	110587	110592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2360	NC_015520	TTGA	2	8	114445	114452	25 %	50 %	25 %	0 %	332980722
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2367	NC_015520	TAT	2	6	114682	114687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332980722
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2370	NC_015520	CTC	2	6	114868	114873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332980722
2371	NC_015520	TCT	3	9	114884	114892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332980722
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2373	NC_015520	TAC	2	6	115027	115032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332980722
2374	NC_015520	T	6	6	115042	115047	0 %	100 %	0 %	0 %	332980722
2375	NC_015520	T	6	6	115068	115073	0 %	100 %	0 %	0 %	332980722
2376	NC_015520	TGC	2	6	115084	115089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332980722
2377	NC_015520	AT	3	6	115094	115099	50 %	50 %	0 %	0 %	332980722
2378	NC_015520	TGT	2	6	115131	115136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2379	NC_015520	TAT	2	6	115152	115157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2380	NC_015520	TAA	2	6	115189	115194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2381	NC_015520	A	6	6	115203	115208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2382	NC_015520	TAA	2	6	115209	115214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2383	NC_015520	A	9	9	115213	115221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2384	NC_015520	AATTTT	2	12	115239	115250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2386	NC_015520	ATA	2	6	115272	115277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2387	NC_015520	AGGA	2	8	115281	115288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2389	NC_015520	TGG	2	6	115410	115415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332980723
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2391	NC_015520	TCT	2	6	115488	115493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332980723
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2404	NC_015520	GCAG	2	8	116174	116181	25 %	0 %	50 %	25 %	332980723
2405	NC_015520	GC	4	8	116192	116199	0 %	0 %	50 %	50 %	332980723
2406	NC_015520	AT	3	6	116299	116304	50 %	50 %	0 %	0 %	332980723
2407	NC_015520	TGGC	2	8	116531	116538	0 %	25 %	50 %	25 %	332980723
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2411	NC_015520	AAAT	2	8	116832	116839	75 %	25 %	0 %	0 %	332980724
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2433	NC_015520	GTT	2	6	117841	117846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2496	NC_015520	GAT	2	6	121036	121041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332980726
2497	NC_015520	GTT	2	6	121089	121094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332980726
2498	NC_015520	CG	3	6	121145	121150	0 %	0 %	50 %	50 %	332980726
2499	NC_015520	CTA	2	6	121197	121202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332980727
2500	NC_015520	GAT	2	6	121206	121211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332980727

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